微卫星不稳定性(MSI)作为一种重要的生物标志物,在癌症的诊断与治疗中正逐渐展现出其独特的价值和广泛的应用前景。起初,MSI的检测主要用于识别林奇综合征(Lynch Syndrome)这类遗传性结直肠癌(CRC)的患者。然而,随着对MSI理解的深入,其在癌症诊疗中的角色已经超越了遗传性癌症的范畴。
近年来随着精准医疗理念的推广,越来越多的癌症治疗策略倾向于根据患者肿瘤的特定分子特征进行个体化治疗。MSI状态作为一种重要的分子标志物,能够帮助识别可能对免疫治疗特别敏感的患者群体,这促进了跨癌种的MSI检测需求。Promega公司与全球领先的医学研究机构合作,共同开发并验证了LMR MSI分析系统,这是一种新型的多重检测方法,旨在提高MSI检测的效率和准确性。该检测系统在《Journal of Molecular Diagnostics》上的发表,标志着这一技术得到了专业领域的认可,对推动MSI在临床实践中的应用具有重要意义。
从标准到革新:跨越时代的进步
2004年在MSI检测领域的一个里程碑式的进展是全单核苷酸重复标记物panel的开发。这种新方法提高了检测dMMR肿瘤的敏感性和特异性。直至2021年,Promega的长单核苷酸重复(LMR)标记物检测系统-LMR MSI分析系统的推出,这一技术革新,显著提升了MSI-PCR检测的性能,提高了检测的敏感性,从而提升MSI作为泛癌种biomarker的可行性。
Brief
论文速读
这项研究囊括了来自20种不同癌症类型的总计469例肿瘤样本,其中包括319例来自林奇综合征患者的样本。研究团队运用最新的Promega LMR MSI分析系统对这些样本进行了MSI检测,并将免疫组化检测法的错配修复缺陷(dMMR)状态数据作为参考标准进行验证,同时与Promega 5位点MSI Panel的结果进行了对比。
敏感性与一致性
结果显示,通过免疫组化法,LMR检测Panel识别dMMR状态在CRC中的敏感性达99%,在非CRC肿瘤中则为96%。LMR与Promega5位点MSI panel在CRC中的一致性达到了99%,而在非CRC肿瘤中为89%。
更高的置信度
除了在dMMR癌症中LMR标记物的增加敏感性外,另一个显著的性能优势是LMR标记物相比SMR标记物展现出更大的等位基因尺寸偏移,这在变异判定上提供了更高的置信度(图4)。
平均尺寸偏移通常与检测dMMR肿瘤表型的能力相关,偏移越小则敏感性越低。部分原因在于从小幅偏移的肿瘤峰中区分出与遗传连锁峰的难度可能导致微卫星模式的误读。LMR标记物的较大尺寸偏移简化了分析并增加了对MSI判定的信心,因为新肿瘤等位基因通常容易与遗传等位基因区分开来。
提高了在MSH6缺陷肿瘤中检测MSI的能力
与LMR标记物较大尺寸偏移相关的另一项性能优势是提高了在MSH6缺陷肿瘤中检测MSI的能力,其他MSI检测方法在这方面曾报道过效果不佳。研究表明,MSI的敏感性可因使用的MSI标记Panel和分析方法的不同而异。使用过时的微卫星标记物Panel和解释方法可能是导致MSH6缺陷肿瘤检测敏感性较低的部分原因。例如,Bethesda Panel包含的二核苷酸重复对MSH6缺陷肿瘤的检测敏感性较低。在当前研究中,使用由单核苷酸重复组成的LMR MSI Panel正确分类了97%的MSH6缺陷肿瘤为MSI-H。
最终,通过实验研究发现,Promega的LMR MSI分析系统通过增加不稳定标记物的数量以及在dMMR肿瘤中观测到的更大等位基因尺寸变动,极大增强了MSI判断的准确性和信心。这一系统拓宽了能够精确识别MSI的癌症类型范围,可能为泛癌种的精准医疗带来新的曙光。
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Promega MSI检测技术
Promega 的 MSI 技术是全球领先的"金标准"级 MSI 检测技术,也是全球第一个商品化的 MSI 检测系统。Promega MSI 5位点技术已经在临床研究中广泛使用了近20年,并被 200 多篇学术论文引用。比 NGS 相比 , Promega MSI 技术更简单 , 成本更低,速度 更快,是可负担的标准化方法,与 IHC-MMR 检测相结合,可将灵敏度和特异性提高到近 100%。
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目前Promega的panel受到多版NCCN指南的明确推荐,同时拥有200多篇同行评审文章的验证。Promega的5位点试剂盒已于2021年获得美国FDA审批用于林奇综合征诊断筛查。并且与多家药厂合作开发其作为PD-1抑制剂用药的伴随诊断试剂。
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Promega 的MSI 经典检测产品采用了5个单态单核苷酸重复微卫星位点设计,这也是美国国家癌症研究所 (NCI) 认可的设计。采用了一组对检测 MSI 状态更敏感而特异的位点,从而得到更精准的结果.
8位点试剂盒是Promega的最新革新MSI检测技术,拥有更高的灵敏度和特异性。
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Promega可提供从样本制备到MSI检测的完整解决方案和文献列表。
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