用于LC-MS分析AAV衣壳蛋白的肽图分析试剂
Peptide Mapping Reagents for LC-MS Analysis of AAV Capsid Proteins
肽图分析常用于确认 AAV 衣壳蛋白的序列和翻译后修饰。由于 AAV 颗粒的特性,使用蛋白质分析的标准样品制备方案很难获得完整的序列覆盖。Promega新型的Magnetic Proteomics Sample Prep (MPSP) Kit 可以与现有的高质量蛋白酶结合使用,用于 AAV 衣壳蛋白样品制备。这种多蛋白酶衣壳图谱分析方案可以几近完整地覆盖整段序列。MPSP 磁珠提供高效的污染清除,可以在非变性蛋白水解条件下使底物变性,并能浓缩稀释样品以进行LC-MS/MS分析。如您对MPSP 磁珠感兴趣,请联系我们。
MPSP 磁珠介绍 
使用SP3蛋白水解衣壳的实验流程
AAV衣壳蛋白肽段序列图谱分析
AAV衣壳蛋白肽段图谱序列覆盖。使用SP3磁珠处理衣壳蛋白。在低pH的AccuMAP™10X Low pH Reaction Buffer中,使用Trypsin Platinum、Arg-C Ultra、rAsp-N和糜蛋白酶进行蛋白水解。E/S比为1:25,蛋白水解在37℃下进行18小时。将肽段从SP3磁珠上分离并进行脱盐处理(C18),随后在接入Thermo NanoLC 1200 LC System的Thermo Scientific Orbitrap Exploris™240 Mass Spectrometer上进行LC-MS/MS。 | ![]() |
用于LC-MS分析AAV衣壳蛋白的肽图分析试剂
试剂 | 主要用途 | 其他信息 |
Trypsin Platinum | 衣壳蛋白序列图谱分析 | 具有极高特异性裂解和极高稳定性的重组胰蛋白酶 |
Arg-C Ultra | 额外的衣壳蛋白覆盖 | 请联系咨询 |
Chymotrypsin | 额外的衣壳蛋白覆盖 | 需要对胰蛋白酶未覆盖的衣壳酸性区进行图谱分析 |
rAsp-N | 额外的衣壳蛋白覆盖 | 需要对胰蛋白酶未覆盖的衣壳蛋白区域进行图谱分析 |
SP3 Sample Cleanup Kit | 蛋白捕获和消化的重要样品制备工具 | 与所有表面活性剂兼容,对稀释过的蛋白(病毒)进行有效富集。请联系咨询 |
Rapid Trypsin/Lys-C | 脱酰胺位点图谱分析的有效工具 | |
PNGase F | 对糖基化位点的图谱分析至关重要 | |
AccuMAP™10X Low pH Reaction Buffer | 最小化衣壳蛋白脱氨反应 | 用于成功进行LC-MS/MS和肽图分析前的蛋白水解 |