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技术 | mRNA原料药的上游制备与质控要点

来源: 发布时间:2026-04-08

从序列到药物:制备mRNA治疗药物

基于mRNA的疗法正在被广泛应用于多个领域,包括疫苗、蛋白替代疗法和免疫疗法等(2)。

在进入任何制剂决策阶段之前,研发团队需要对RNA本身建立充分的信心:确保其具有正确的序列、合适的特性以及足够的纯度,从而保证下游流程的可预测性。这正是将原料药与药品进行区分的意义所在。原料药是指能够产生药理作用的活性成分,而药品则是含有该成分的成品制剂(6)。

本文聚焦于上游环节——即制剂之前,mRNA原料药的制备过程。具体而言,这段上游工作涵盖了mRNA构建体的选择、通过体外转录(IVT)进行生产,以及对产物进行纯化和分析,以确保其具备所需的质量属性(5)。


什么是mRNA构建体?

mRNA构建体是研发团队经过设计、推进并期望其能够表达治疗性蛋白(或实现其他治疗效果)的RNA序列(2)。在这一阶段,它仍处于设计层面,但目标是将该设计转化为原料药:一种可重复生产、特性明确的mRNA物料,能够支持后续的研发推进。在早期开发阶段,“构建体”听起来可能有些抽象,但实质问题在于:你是否能够持续稳定地生产出与设计一致的高质量mRNA。


IVT背后的核心科学原理

在研发流程中,生成mRNA的常用方法是使用体外转录(IVT),这是一种以DNA为模板、无细胞的RNA合成过程。概括而言, IVT可以理解为将DNA模板与核糖核苷酸以及RNA聚合酶相结合,以合成RNA(2,4)。IVT通常使用噬菌体RNA聚合酶进行反应,如T7、T3或SP6,具体选择取决于模板中构建的启动子序列(3,4)。

IVT的成功依赖于精心设计的模板:DNA模板包含位于目标序列上游的启动子序列(例如T7)、5'和3'非翻译区以及poly(A)尾(4)。


实际应用示例:T7 RiboMAX™ Express 大规模RNA生产系统是一款体外转录(IVT)系统,专为在短时间内稳定生产大量RNA而设计(3,5)。

mRNA制备的简易流程指南


1.    构建用于转录的模板
 模板的形式决定了聚合酶能合成什么样的产物,以及后续结果分析的清晰度。常见的模板类型包括:线性化质粒、整合了启动子序列的PCR产物,或退火后的寡核苷酸模板(通常用于合成较短的RNAs;4)。


2.    设计IVT反应(概念层面)
 大多数IVT流程依赖相同核心类别的组分:聚合酶、rNTPs,以及用于保护RNA和支持反应性能的辅助试剂。常见类别包括T7 RNA聚合酶、RNase抑制剂和无机焦磷酸酶(4,8,10)。为方便团队进行比较,Promega还提供了高产IVT试剂盒的并列对比,可作为选择适合您RNA生产需求的系统时的实用参考起点(5)。


3.    决定RNA在下游的性能要求
 根据目标应用的不同,团队可以选择加帽或未加帽的RNA,以及标准或修饰的核苷酸(5)。总体而言,这些选择会影响翻译的启动效率、产物的稳定性以及分析表征的效果。在转录起始阶段也可以使用帽类似物,以生成更接近天然结构的5'端,从而支持后续的翻译过程(2,4)。


以上是上游环节的主要决策点,但典型的工作流程在进入制剂之前,还包括模板去除、纯化和基础表征等步骤(5)。

IVT mRNA生产中的变异性来源


在mRNA合成过程中,最常见的困扰之一是:获得的物料初看之下似乎合格,但实则携带杂质或不均一性,这些问题后续会表现为批间差异、翻译效率低下或结果解读困难。

影响产量和mRNA质量的变量众多,但有几个反复出现的问题贯穿于各类工作流程,包括生产变量、纯化过程中的取舍以及规模敏感性:

1.    序列与构建体设计
 变异性往往始于序列和转录本设计层面。密码子使用偏好、序列组成(包括GC含量)以及结构元件等因素,都会影响转录效率以及全长产物生成的一致性(4)。转录本末端的设计选择也至关重要,包括5'端、3'端加尾方式以及UTR的选择,因为这些决策会影响下游的翻译性能,以及表征过程中需要验证的内容(2,4)。

2.    反应设计与组分
 反应体系的设置同样关键:聚合酶的选择、使用标准还是修饰的核苷酸,以及用于保护RNA和支持反应性能的辅助试剂,都会导致不同批次间的产量和一致性发生波动(4)。由于IVT反应环境同时影响产物完整性和副产物生成,团队通常将反应优化视为与纯化同等重要的生产工艺组成部分,而非一个孤立步骤(4)。

3.    纯化与后处理
 转录完成后,下一步的概念相对明确:去除不需要保留的组分。然而,在实践中,当需要在回收率与一致性之间取得平衡时,这一步骤可能变得异常困难。纯化旨在将mRNA与残留的反应组分(如酶、核苷酸、DNA模板和dsRNA)分离开,以免这些杂质干扰下游表征分析或功能性检测(4,5)。我们的IVT纯化指南将mRNA从IVT反应中纯化作为工作流程中的一个明确步骤。在许多方法中,mRNA被捕获在层析柱或磁珠上,经过洗涤,最后洗脱至小体积溶液中(7)。

查看新型dsRNA检测方法介绍

4. 规模改变规则

许多在单管中看似稳定的工作流程,随着体积和通量的增加会变得敏感。即使在早期较小规模的生产阶段,可放大性也通常被视为首要考虑因素,而非一个未来才需解决的问题。尽早进行规模化生产规划,通常意味着标准化原料并记录反应条件,以确保随着体积和通量的变化,结果仍具有可比性(5,10)。

无动物源成分的应用场景


无动物源成分(AOF)以及符合cGMP标准生产的原料之所以重要,是出于一个实际原因:它们能够减少可避免的变量。动物来源的原材料可能引入额外的变异性,并增加追溯及风险评估的负担(包括TSE/BSE考量),因此,采用AOF原料有助于在早期阶段同时降低科学层面和监管层面的不确定性(8,10)。

随着项目逐步推进,团队往往会更加重视原料的一致性、可追溯性以及文档记录。使用特性明确的IVT试剂,并记录批次间的性能表现,有助于在工作流程放大以及要求日益规范化的过程中,减少可避免的变异性(8,10)。

如果您对无动物源成分的IVT感兴趣,请访问RiboMAX™ AOF RNA生产系统页面了解更多信息(3,5)。

探索灵活、可扩展的RNA生产解决方案


我们的RiboMAX™ mRNA生产解决方案提供高产的体外转录系统,并提供符合cGMP标准及无动物源成分的IVT试剂选项。当与Promega可扩展、适配自动化的纯化技术配合使用时,我们的IVT系统能够实现高质量mRNA的生产。


发现用于mRNA的表征与QC检测方案



我们全面的mRNA分析表征与质控解决方案组合,能够实现对mRNA质量的灵敏、定量评估。我们提供用于dsRNA杂质检测、RNA准确定量以及基于细胞的效力测定的检测方法,以确保mRNA疗法的安全性、一致性和有效性。


如果您正在探索上游工作流程的各种方案,我们的mRNA治疗解决方案介绍了如何在不同开发阶段为RNA合成、纯化和表征提供支持(5,10)。

查看mRNA解决方案


在许多项目中,下游环节的挑战往往可以追溯到上游的基础环节。当mRNA的生产过程通过合理的模板设计、高质量的IVT试剂、可靠的纯化工艺以及早期质控被明确时,随着工作的推进,故障排除、规模放大以及保持可比性都将变得更加容易(4,5)。即使在早期阶段,对长度/异质性以及dsRNA等关键杂质进行筛查,也有助于避免下游出现令人困惑的检测结果(4,5)。


参考文献

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  1. Beckert, B., & Masquida, B. (2010). Synthesis of RNA by in vitro transcription. RNA, 703, 29–41. 

    https://doi.org/10.1007/978-1-59745-248-9_3

  2. Garber, K. (2022). mRNA pioneers refocus on therapeutics. Nature Reviews Drug Discovery, 21, 699–701. 

    https://www-nature-com.ezprom01.infotrieve.com/articles/d41573-022-00156-5

  3. In Vitro Transcription | RNA Synthesis Kits | RNA Production. (2026). Promega.com. 

    https://www.promega.com/products/rna-analysis/in-vitro-transcription/

  4. Lenk, R., Kleindienst, W., Szabó, G. T.,Baiersdörfer, M., Boros, G., Keller, J. M., Mahiny, A. J., & Vlatkovic, I. (2024). Understanding the impact of in vitro transcription byproducts and contaminants. Frontiers in Molecular Biosciences, 11. 

    https://doi.org/10.3389/fmolb.2024.1426129

  5. mRNA Therapy Solutions. (2026). Promega.com. 

    https://www.promega.com/applications/gene-therapy-tools/rna-therapy/mrna-therapy-solutions/

  6. Patel, P. R. (2023). Chemistry, Manufacturing and Controls: Regulatory Considerations Through Clinical Development. 

    https://www.fda.gov/media/175396/download

  7. Promega Corporation. (2024, June). IVT RNA ProNex [Application note] (Publication No. PA1001; Version 06/24). 

    https://promega.widen.net/s/hchgrkqvrm/ivt-rna-pronex-pa1001

  8. Promega Corporation. (2024, October). Custom raw materials for mRNA synthesis [Flyer] (Publication No. FL682I). 

    https://promega.widen.net/s/jvwcfpprrd/custom-raw-materials-for-mrna-synthesis-a4-fl682i-print

  9. Promega Corporation. (2025, October). In vitro transcription [Flyer] (Publication No. GFN368). 

    https://promega.widen.net/s/rpss2spqkz/ivtranscription_ltr_gfn368

  10. Raw Materials for mRNA Therapeutic Manufacture.

     (2026). Promega.com. 

    https://www.promega.com/custom-solutions/custom-manufacturing/mrna-manufacturing/



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T7 RiboMAX™ Express 大规模RNA生产系统

1 system

P1320

RiboMAX™ AOF RNA生产系统

1 each

P2000

Lumit® dsRNA Detection Assay

可提供的即用型检测试剂盒及标准品包括:

  • 非修饰型

  • mo5U: 5-甲氧基尿苷

  • m5C: 5-甲基胞苷

  • m1Ψ: N1-甲基假尿苷

  • Ψ: 假尿苷

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